在屬水平上，百香將相對豐度排名前30位的果连屬進行聚類分析，繪製成熱圖(圖4)，作对結果顯示相對豐度排名前30位的土壤細菌來源於變形菌門(Proteobacteria)、酸杆菌門(Acidobacteria)、细菌响放線菌門(Actinobacteria)、群落浮黴菌門 (Planctomycetes)、结构綠彎菌門(Chloroflexi)、百香WPS-2、果连己科河菌門(Rokubacteria)、作对厚壁菌門(Firmicutes)和芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)等9個門類，土壤其中變形菌門、细菌响酸杆菌門和放線菌門占前30屬中的群落66.7%，分別為10屬、结构5屬和5屬。百香
所有樣本中，相對豐度大於1%的屬有24屬，相對豐度占58.51%，其中相對豐度最高的10屬占總豐度的40.68%，依次分別為酸杆菌門Subgroup_2目下的未定名屬(占8.57%)、變形菌門根瘤菌目的未定名屬(占5.12%)、酸杆菌目未定名屬(占4.81%)、熱酸菌屬(Acidothermus,占4.38%)、Elsterales目未定名屬(占3.52%)、出芽菌科(Gemmataceae)未定名屬(占2.78%)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium, 占2.71%)、Candidatus Solibacter(占2.43%)、水球菌屬(Aquisphaera, 占2.16%)、酸杆菌門Subgroup_6綱下未定名屬(占2.11%)、變形菌門Acidibacter屬(占2.09%)。
方差分析表明，不同連作年限土壤細菌間，前30屬的相對豐度差異顯著(P<0.05)，其中酸杆菌門Subgroup_2目下的未定名屬、Aquisphaera、Acidibacter、Bryobacter、分枝杆菌屬(Mycobacterium)等屬的豐度隨連作年限的增加而顯著降低，而芽孢杆菌屬(Bacillus)、酸杆菌門Subgroup_6綱下未定名屬等屬豐度隨連作年限增加而顯著增大。
為了進一步對細菌群落物種組成差異進行分析，探討不同連作年限間群落細菌組成的相似性或差異性，基於Bray-Curtis距離算法，采用主坐標分析(PCoA)對不同連作年限土壤細菌群落差異進行分析，結果如圖5所示，在OUT水平上，PC1 與 PC2 分別解釋方差為54.96%和17.02%，累計解釋能力達71.98%，不同連作年限間土壤細菌群落差異顯著(P=0.001，R=1)，撂荒地土壤樣本與百香果種植地樣本在第一主成分上很好地被區分，種植第一年(TF)與種植第二年(TS)土壤細菌群落組成較相近；每個處理的三個重複樣本的聚集性較好，顯示出較好的重複性，第一年種植的土壤細菌組內差異較大。同時，采用Bray-Curtis算法對15個土壤樣本細菌群落進行樣本層級聚類分析，結果表明(如圖6)：15個土壤樣本明顯聚集為5組，與5個連作年限對應，其中連作3年的樣本(TT)單獨為一簇，與其他4個樣本分開；第一年種植(TF)和第二年種植(TS)的樣本與撂荒地(TZ)的相似距離較近，說明百香果連作顯著影響土壤細菌群落結構。
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